中心鼓励科研人员瞄准数学科学重大国际前沿问题和学科发展方向，加强问题导向、目标导向类的重大基础研究；同时，鼓励自由探索类基础研究；鼓励跨学科交叉研究，鼓励探索新思想、新理论和新方法的研究。

经过十余年发展，数学中心学科建设布局合理，稳步推进，以基础数学为核心，组建了包括基础数学和应用数学、计算数学在内的多个高水平学科团队，形成“五大领域”“三个交叉研究方向”的学科布局。每年发表各类论文百余篇。2022年数学中心教师发表SCI论文147篇，包括国际顶刊发表的论文。

六大研究方向包括代数、代数几何、数论方向；几何拓扑方向；分析、PDE、动力系统方向；数学物理方向；应用数学方向；概率统计方向。其中，代数与数论、数学物理以及动力系统与随机分析这三个科研团队，已达到世界顶尖水平。